Le Projet Marmotte Alpine

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Coraline Bichet

espace

Post-doctorante 2013-2016

courriel: coraline.bichet@gmail.com

Post-doctorante 2013-2016

Post-doctorante 2013-2016

Titulaire d’un doctorat en écologie évolutive de l’Université de Bourgogne, Dijon. Mon principal axe de recherche consiste à relier l’écologie comportementale, l’immuno-écologie et l’écologie moléculaire afin de comprendre l’origine et le maintien de la variabilité génétique des populations naturelles.

Projets


La diversité génétique résulte de l’interaction entre différents processus : certains agissent au niveau de parties du génome, comme les mutations ou les recombinaisons ; d’autres sont indépendants du génome et l’affecte entièrement, comme les processus démographiques. D’autres processus résultent de l’exposition de la diversité génétique à un environnement donné, comme la sélection naturelle ou sexuelle. La contribution de chaque processus dans l’évolution de la diversité génétique reste mal comprise. En se focalisant sur une espèce emblématique, la marmotte alpine (Marmota marmota), je tenterai de démêler le rôle relatif des processus démographiques et sélectifs dans la diversité génétique actuellement observée dans les populations.

OBJECTIF 1 – Evaluer et comprendre la diversité génétique neutre et adaptative – De nombreuses études ont montré que les marmottes présentaient une diversité génétique relativement faible, mais les causes de ce phénomène sont encore méconnues. En utilisant conjointement des marqueurs génétiques neutres et sélectionnés (les gènes du CMH), j’évaluerai et comparerai les caractéristiques génétiques individuelles et populationnelles chez les marmottes vivant dans les Alpes et dans les Pyrénées.

OBJECTIF 2 – Déterminer quelles caractéristiques génétiques sont impliquées dans le choix du partenaire – Le choix du partenaire est généralement supposé être impliqué dans les caractéristiques génétiques du CMH. Ici, nous rechercherons les caractéristiques génétiques impliquées dans le choix du partenaire chez les marmottes alpines.

OBJECTIF 3 – Identifier les facteurs démographiques et les processus sélectifs à l’origine de la diversité génétique –  En utilisant des échantillons fossiles et des données à long terme, nous serons capables d’étudier les variations de diversité génétique à différentes échelles de temps, et donc de comprendre le rôle des événements démographiques dans la diversité génétique actuelle et passée. En comparant la diversité CMH des populations exposées à différentes histoires évolutives et à différentes pressions de sélection (différents niveaux de consanguinité et de pathogènes), nous tenterons de comprendre comment les pressions de sélection et les processus démographiques peuvent impacter les caractéristiques génétiques étudiées.

 

Financements

ANR CMateChoice
Région Rhône-Alpes COOPERA (15 k€)

Publications

Cohas, A., Rey, B., Federico, V., Regis, C., Lardy, S., and Bichet, C. (2018). Stress levels of dominants reflect underlying conflicts with subordinates in a cooperatively breeding species. Behavioral Ecology and Sociobiology, 72: 72. pdf

Bichet C., Sauzet S., Averty L., Dupont P., Ferrandiz-Rovira M., Ferrari C., Figueroa I., Tafani M., Rézouki C., López BC., Cohas, A. (2016) Multiple geographic origins and high genetic differentiation of the Alpine marmots reintroduced in the Pyrenees. Conservation Genetics, 17: 1157–1169. pdf

Bichet, C., Lepetit, D., Cohas, A. (2018). Extrinsic and intrinsic constraints interact to drive extra‐pair paternities in the Alpine marmot. Journal of evolutionary biology, 31: 1794-1802. pdf

Bichet C., Allainé D., Sauzet S. Cohas A. (2016) Faithful or not: direct and indirect effects of climate on extra-pair paternities in a population of Alpine marmots. Proceedings of the Royal Society B, 283: 20162240. http://dx.doi.org/10.1098/rspb.2016.2240. pdf

Bichet C., Sauzet S., Averty L., Dupont P., Ferrandiz-Rovira M., Ferrari C., Figueroa I., Tafani M., Rézouki C., López BC., Cohas, A. (2016) Multiple geographic origins and high genetic differentiation of the Alpine marmots reintroduced in the Pyrenees. Conservation Genetics, 17: 1157–1169. pdf

Présentations, Posters

Bichet C., Ferrandiz-Rovira M., Cohas A. (2018) Multiple geographic origins and high genetic differentiation of the Alpine marmots reintroduced in the Pyrenees. Functional Ecology Conference, Nancy, France. pdf.

Bichet C., Allainé D., Sauzet S., Cohas A. (2017) Direct and indirect effects of climate on extra-pair paternities in a population of Alpine marmots. European Society for Evolutionary Biology, 16th Congress, Groningen, The Netherlands.