Le Projet Marmotte Alpine

Bienvenue au sein du Projet Marmotte Alpine

Mariona Ferrandiz-Rovira

espace

 

Doctorante 2011-2015

 

 

 

Après sa thèse Mariona a rejoint l’Université Autonome de Barcelone et le CREAF en tant que post-doctorante (5 ans).

Projet de thèse

La diversité génétique intra-spécifique constitue le potentiel adaptatif des espèces et, à ce titre, elle est donc indispensable pour l’évolution de celles-ci. Chez les vertébrés, les gènes du complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) sont une composante essentielle de quoi permet de faire face aux parasites en initiant une réponse immunitaire. La pression de sélection exercée par les parasites et la sélection sexuelle via le choix du partenaire devraient donc agir sur la diversité génétique du CMH. Cependant, la distinction empirique des pressions sélectives agissant sur la diversité génétique du CMH en milieu naturel nécessite de suivre un grand nombre individus tout au long de leur vie et d’effectuer leur génotypage. Le premier objectif de cette thèse a donc été développer et appliquer un protocole de génotypage chez la marmotte Alpine (Marmota marmota), sur quatre loci du CMH décrits précédemment. Ceci permet par la suite d’étudier, dans une population de marmottes Alpines vivant en milieu naturel, si les caractéristiques génétiques du CMH influencent (1) le choix de partenaire, (2) la présence et/ou l’abondance de trois espèces de parasites intestinaux et (3) leur survie juvénile. Ce travail a fourni une méthode appropriée pour la détermination de génotypes fiables sur un grand nombre d’échantillons en utilisant des techniques de séquençage de nouvelle génération. Ensuite, nous avons constaté l’existence d’un choix de partenaire basé sur le CMH mais aussi sur les caractéristiques de l’ensemble du génome. Par la suite, nous avons mis en évidence le faible rôle du CMH sur la présence et abondance de trois espèces de parasites intestinaux. Finalement, nous avons constaté que l’association entre la survie juvénile et les caractéristiques génétiques du CMH et de l’ensemble du génome ont changé au cours des vingt-trois ans de suivi de la population. Dans l’ensemble, cette thèse présente une approche intégrée de l’étude des rôles du CMH sur une population contemporaine de marmottes Alpines.

The role of the major histocompatibility complex in the wild: the case of the Alpine marmot (Marmota marmota). Thèse de doctorat. Université Claude Bernard Lyon 1, Lyon. pdf

Financement

Bourse de thèse:

– VetAgrosup (Otobre 2013 – Mars 2015)
– Obra Social Fundació “La Caixa” (Octobre 2011 – Septembre 2013)

Bourse de master:
– Bourse de movilidad Ministerio de Educación (Fevrier-Juin 2011) Stage de formation au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (Lyon)
– Bourse Argo du Ministerio de Educación Español (Avril – Septembre 2010) Stage de formation au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (Lyon)

Publications

Ferrandiz-Rovira M., Allainé D., Callait-Cardinal MP. and Cohas A. (2016). Mate choice for neutral MHC genètic characteristics in Alpine marmots: diferent targets in different contexts? Ecology and Evolution, 6:4243-4257. pdf

Bichet C., Sauzet S., Averty L., Dupont P., Ferrandiz-Rovira M., Ferrari C., Figueroa I., Tafani M., Rézouki C., López BC., and Cohas, A. (2016). Multiple geographic origins and high genetic differentiation of the Alpine marmots reintroduced in the Pyrenees. Conservation Genetics, 17: 1157–1169. pdf

Ferrandiz-Rovira, M., T. Bigot, D. Allainé, M-P. Callait-Cardinal and A. Cohas. (2015). Large-scale genotyping of highly polymorphic loci by next-generation sequencing: how to overcome the challenges to reliably genotype individuals? Heredity, 114: 485-93. pdf

Ferrandiz-Rovira, M., J-F. Lemaître, S. Lardy, B. Claramunt-Lopez and A. Cohas. (2014). Do pre- and post-copulatory traits covary in large herbivores? BMC Evolutionary Biology 14:79. pdf

Conférences

Ferrandiz-Rovira, M., Cohas A, Allainé D. and Callait-Cardinal M-P. Specific alleles of the major histocompatibility complex (mhc) class ii and age influence prevalence or abundance of intestinal parasites in alpine marmots (Marmota marmota). World Association for the Advancement of Veterinary Parasitology (WAAVP), Liverpool, UK, August 16th – 20th. pdf

Ferrandiz-Rovira, M., Bigot T., Allainé D., Callait-Cardinal M-P., Radwan J. and Cohas A. (2013). Large-scale genotyping by next generation sequencing: how to overcome the challenges to reliably genotype individuals? 2ème Colloque Génomique Environnementale, Rennes, France pdf

Ferrandiz-Rovira, M., J-F. Lemaître, S. Lardy, B. Claramunt-Lopez and A. Cohas. (2012) Evolutionary trade-off between weapon length and sperm size in large herbivores. 8th Ecology and Behaviour,SERL in Chizé (France).

Vulgarisation

La 2 Noticias (2016) La marmota infiel 30/05/2016

Naya A. (2016) CREAF Female marmots “cheat on” their male partners 30/05/2016

La Vanguardia (2016)  Las hembras de marmotas son infieles para evitar la consanguineidad 30/05/2016

Gonay A. (2014) Film: Des scientifiques dans la montagne

Dupuis F. (2013) ALPES NATURE : Vanoise, objectif marmotte !  Alpes Magazine, n°142. pdf

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